化學分離法是將粗產品或原料干燥、磨碎后，采用化學試劑提取而制備各種DF的方法，以堿法應用較普遍。

化學分離法大概工藝流程是原料經過干燥、磨碎過篩處理后，加入氫氧化鈉、氫氧化鈣處理，隨后是過濾處理，過濾所得殘渣即為水不溶性膳食纖維，將所得濾液的pH值調在4.0～4.5并離心處理，其沉淀物為蛋白質，將所得上清液的pH值調至6.0～7.0并用酒精沉淀，沉淀物即為水溶性膳食纖維。

化學分離法如果提取過程中改變堿液濃度，并輔以其它化學試劑，還可將水溶性或水不溶性膳食纖維進一步分離。除堿法外還有酸法、絮凝劑法等。